Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MDC1Q14676 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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