Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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