Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL9A3Q14050 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL9A3Q14050 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms