Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKP1Q13835 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKP1Q13835 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
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