Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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CUL4AQ13619 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CUL4AQ13619 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUL4AQ13619 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
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