Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MKRN4PQ13434 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN4PQ13434 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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