Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SRSF5Q13243 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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