Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME3Q13232 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME3Q13232 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME3Q13232 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME3Q13232 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NME3Q13232 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NME3Q13232 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NME3Q13232 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME3Q13232 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME3Q13232 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME3Q13232 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME3Q13232 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME3Q13232 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME3Q13232 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME3Q13232 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME3Q13232 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME3Q13232 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME3Q13232 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME3Q13232 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME3Q13232 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME3Q13232 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME3Q13232 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME3Q13232 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME3Q13232 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME3Q13232 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME3Q13232 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME3Q13232 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NME3Q13232 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME3Q13232 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME3Q13232 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME3Q13232 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME3Q13232 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME3Q13232 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME3Q13232 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME3Q13232 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME3Q13232 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME3Q13232 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NME3Q13232 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME3Q13232 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NME3Q13232 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME3Q13232 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME3Q13232 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME3Q13232 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME3Q13232 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME3Q13232 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NME3Q13232 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME3Q13232 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME3Q13232 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME3Q13232 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME3Q13232 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME3Q13232 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME3Q13232 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME3Q13232 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME3Q13232 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME3Q13232 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME3Q13232 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME3Q13232 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME3Q13232 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME3Q13232 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME3Q13232 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME3Q13232 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME3Q13232 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME3Q13232 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME3Q13232 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME3Q13232 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME3Q13232 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME3Q13232 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME3Q13232 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME3Q13232 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME3Q13232 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME3Q13232 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME3Q13232 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NME3Q13232 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NME3Q13232 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME3Q13232 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME3Q13232 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME3Q13232 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME3Q13232 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME3Q13232 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME3Q13232 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME3Q13232 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME3Q13232 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME3Q13232 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME3Q13232 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME3Q13232 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME3Q13232 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME3Q13232 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME3Q13232 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME3Q13232 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NME3Q13232 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME3Q13232 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME3Q13232 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NME3Q13232 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME3Q13232 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME3Q13232 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME3Q13232 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NME3Q13232 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME3Q13232 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME3Q13232 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NME3Q13232 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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