Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIPPLY1Q0D2K3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIPPLY1Q0D2K3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms