Protein–RNA interactions for Protein: Q08380

LGALS3BP, Galectin-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS3BPQ08380 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LGALS3BPQ08380 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms