Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ID3Q02535 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ID3Q02535 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ID3Q02535 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ID3Q02535 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ID3Q02535 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ID3Q02535 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ID3Q02535 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ID3Q02535 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ID3Q02535 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
ID3Q02535 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ID3Q02535 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ID3Q02535 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ID3Q02535 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ID3Q02535 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ID3Q02535 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ID3Q02535 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ID3Q02535 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ID3Q02535 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ID3Q02535 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ID3Q02535 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ID3Q02535 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ID3Q02535 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ID3Q02535 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ID3Q02535 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ID3Q02535 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ID3Q02535 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ID3Q02535 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ID3Q02535 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ID3Q02535 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ID3Q02535 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ID3Q02535 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ID3Q02535 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ID3Q02535 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ID3Q02535 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ID3Q02535 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms