Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFKB2Q00653 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms