Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2BQ00403 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2BQ00403 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms