Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHOBP62745 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOBP62745 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOBP62745 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOBP62745 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOBP62745 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOBP62745 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOBP62745 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOBP62745 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOBP62745 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOBP62745 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOBP62745 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOBP62745 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOBP62745 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOBP62745 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOBP62745 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOBP62745 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOBP62745 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOBP62745 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOBP62745 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOBP62745 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOBP62745 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOBP62745 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOBP62745 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOBP62745 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOBP62745 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOBP62745 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOBP62745 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOBP62745 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOBP62745 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHOBP62745 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHOBP62745 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHOBP62745 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHOBP62745 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHOBP62745 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHOBP62745 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHOBP62745 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHOBP62745 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHOBP62745 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHOBP62745 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHOBP62745 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHOBP62745 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHOBP62745 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHOBP62745 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHOBP62745 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms