Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
ROMO1P60602 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms