Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMTNP53814 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMTNP53814 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMTNP53814 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMTNP53814 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMTNP53814 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMTNP53814 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMTNP53814 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMTNP53814 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMTNP53814 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMTNP53814 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMTNP53814 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMTNP53814 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMTNP53814 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMTNP53814 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMTNP53814 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMTNP53814 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMTNP53814 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMTNP53814 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMTNP53814 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMTNP53814 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMTNP53814 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMTNP53814 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMTNP53814 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMTNP53814 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMTNP53814 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMTNP53814 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMTNP53814 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMTNP53814 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMTNP53814 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMTNP53814 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMTNP53814 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMTNP53814 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMTNP53814 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMTNP53814 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMTNP53814 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMTNP53814 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMTNP53814 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMTNP53814 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMTNP53814 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMTNP53814 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMTNP53814 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMTNP53814 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMTNP53814 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMTNP53814 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMTNP53814 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMTNP53814 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMTNP53814 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMTNP53814 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMTNP53814 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMTNP53814 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMTNP53814 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMTNP53814 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMTNP53814 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMTNP53814 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMTNP53814 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMTNP53814 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMTNP53814 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMTNP53814 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMTNP53814 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMTNP53814 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMTNP53814 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMTNP53814 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMTNP53814 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMTNP53814 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMTNP53814 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMTNP53814 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMTNP53814 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMTNP53814 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMTNP53814 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMTNP53814 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMTNP53814 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMTNP53814 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMTNP53814 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMTNP53814 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMTNP53814 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMTNP53814 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMTNP53814 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMTNP53814 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMTNP53814 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMTNP53814 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMTNP53814 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMTNP53814 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMTNP53814 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMTNP53814 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMTNP53814 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMTNP53814 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMTNP53814 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMTNP53814 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMTNP53814 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMTNP53814 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMTNP53814 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMTNP53814 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMTNP53814 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMTNP53814 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMTNP53814 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMTNP53814 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMTNP53814 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMTNP53814 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMTNP53814 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
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