Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRE11P49959 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRE11P49959 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRE11P49959 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MRE11P49959 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRE11P49959 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRE11P49959 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRE11P49959 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRE11P49959 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRE11P49959 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MRE11P49959 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRE11P49959 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRE11P49959 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRE11P49959 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRE11P49959 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRE11P49959 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRE11P49959 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRE11P49959 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRE11P49959 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRE11P49959 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRE11P49959 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRE11P49959 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRE11P49959 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRE11P49959 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRE11P49959 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRE11P49959 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRE11P49959 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRE11P49959 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRE11P49959 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRE11P49959 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRE11P49959 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRE11P49959 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRE11P49959 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRE11P49959 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MRE11P49959 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRE11P49959 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRE11P49959 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRE11P49959 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRE11P49959 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRE11P49959 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRE11P49959 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRE11P49959 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRE11P49959 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRE11P49959 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRE11P49959 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRE11P49959 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRE11P49959 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRE11P49959 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRE11P49959 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRE11P49959 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRE11P49959 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRE11P49959 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRE11P49959 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRE11P49959 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRE11P49959 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRE11P49959 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MRE11P49959 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRE11P49959 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRE11P49959 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRE11P49959 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRE11P49959 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MRE11P49959 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRE11P49959 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRE11P49959 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRE11P49959 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRE11P49959 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRE11P49959 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRE11P49959 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRE11P49959 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRE11P49959 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRE11P49959 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRE11P49959 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRE11P49959 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRE11P49959 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MRE11P49959 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRE11P49959 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRE11P49959 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRE11P49959 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRE11P49959 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRE11P49959 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRE11P49959 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRE11P49959 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRE11P49959 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRE11P49959 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRE11P49959 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRE11P49959 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRE11P49959 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRE11P49959 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRE11P49959 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRE11P49959 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRE11P49959 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRE11P49959 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MRE11P49959 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRE11P49959 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRE11P49959 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRE11P49959 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRE11P49959 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRE11P49959 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRE11P49959 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRE11P49959 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms