Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNA7P36544 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms