Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRS3P32247 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BRS3P32247 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRS3P32247 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRS3P32247 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRS3P32247 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRS3P32247 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRS3P32247 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRS3P32247 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRS3P32247 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BRS3P32247 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRS3P32247 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRS3P32247 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRS3P32247 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRS3P32247 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRS3P32247 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRS3P32247 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRS3P32247 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRS3P32247 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRS3P32247 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRS3P32247 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRS3P32247 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRS3P32247 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRS3P32247 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BRS3P32247 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BRS3P32247 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms