Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP1P29466 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP1P29466 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP1P29466 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASP1P29466 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP1P29466 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP1P29466 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP1P29466 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP1P29466 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP1P29466 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP1P29466 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP1P29466 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP1P29466 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP1P29466 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP1P29466 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP1P29466 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP1P29466 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP1P29466 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP1P29466 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP1P29466 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP1P29466 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP1P29466 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP1P29466 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP1P29466 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP1P29466 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP1P29466 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP1P29466 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP1P29466 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP1P29466 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASP1P29466 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CASP1P29466 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CASP1P29466 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CASP1P29466 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CASP1P29466 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP1P29466 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP1P29466 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP1P29466 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP1P29466 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP1P29466 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP1P29466 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP1P29466 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP1P29466 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP1P29466 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASP1P29466 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP1P29466 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP1P29466 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP1P29466 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP1P29466 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP1P29466 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP1P29466 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP1P29466 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP1P29466 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP1P29466 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP1P29466 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP1P29466 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP1P29466 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP1P29466 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP1P29466 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP1P29466 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP1P29466 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP1P29466 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP1P29466 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP1P29466 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP1P29466 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASP1P29466 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASP1P29466 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms