Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA1P20827 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms