Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNA2P20248 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms