Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RLBP1P12271 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms