Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MS4A1P11836 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A1P11836 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms