Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C8orf88P0DMB2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C8orf88P0DMB2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms