Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC3P02656 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC3P02656 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC3P02656 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC3P02656 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC3P02656 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC3P02656 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC3P02656 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC3P02656 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC3P02656 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC3P02656 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC3P02656 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC3P02656 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC3P02656 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC3P02656 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC3P02656 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC3P02656 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC3P02656 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOC3P02656 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC3P02656 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC3P02656 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC3P02656 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC3P02656 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC3P02656 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC3P02656 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC3P02656 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC3P02656 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC3P02656 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC3P02656 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC3P02656 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC3P02656 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC3P02656 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC3P02656 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC3P02656 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC3P02656 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC3P02656 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC3P02656 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC3P02656 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC3P02656 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC3P02656 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC3P02656 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC3P02656 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOC3P02656 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOC3P02656 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC3P02656 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC3P02656 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC3P02656 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC3P02656 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC3P02656 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC3P02656 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC3P02656 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC3P02656 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC3P02656 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC3P02656 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC3P02656 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC3P02656 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC3P02656 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC3P02656 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC3P02656 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC3P02656 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC3P02656 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC3P02656 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC3P02656 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC3P02656 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APOC3P02656 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms