Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFT2D2O95562 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D2O95562 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms