Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRD4O60885 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD4O60885 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD4O60885 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD4O60885 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD4O60885 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD4O60885 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD4O60885 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD4O60885 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD4O60885 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD4O60885 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD4O60885 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD4O60885 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD4O60885 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD4O60885 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD4O60885 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD4O60885 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD4O60885 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRD4O60885 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRD4O60885 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRD4O60885 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRD4O60885 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRD4O60885 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRD4O60885 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRD4O60885 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRD4O60885 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRD4O60885 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRD4O60885 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
BRD4O60885 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRD4O60885 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRD4O60885 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRD4O60885 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRD4O60885 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRD4O60885 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRD4O60885 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRD4O60885 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRD4O60885 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRD4O60885 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRD4O60885 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRD4O60885 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRD4O60885 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRD4O60885 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRD4O60885 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRD4O60885 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRD4O60885 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRD4O60885 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRD4O60885 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRD4O60885 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRD4O60885 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRD4O60885 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
BRD4O60885 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
BRD4O60885 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD4O60885 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD4O60885 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD4O60885 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD4O60885 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD4O60885 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD4O60885 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD4O60885 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD4O60885 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD4O60885 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD4O60885 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD4O60885 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD4O60885 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD4O60885 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD4O60885 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD4O60885 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD4O60885 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD4O60885 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD4O60885 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD4O60885 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRD4O60885 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRD4O60885 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRD4O60885 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRD4O60885 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRD4O60885 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
BRD4O60885 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRD4O60885 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRD4O60885 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRD4O60885 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRD4O60885 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRD4O60885 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRD4O60885 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
BRD4O60885 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRD4O60885 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRD4O60885 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRD4O60885 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRD4O60885 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRD4O60885 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRD4O60885 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRD4O60885 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRD4O60885 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRD4O60885 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRD4O60885 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRD4O60885 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRD4O60885 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRD4O60885 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRD4O60885 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRD4O60885 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRD4O60885 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms