Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKAB2O43741 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms