Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGRNO00468 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGRNO00468 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGRNO00468 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
AGRNO00468 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGRNO00468 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGRNO00468 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGRNO00468 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGRNO00468 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGRNO00468 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGRNO00468 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGRNO00468 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGRNO00468 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGRNO00468 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGRNO00468 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGRNO00468 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGRNO00468 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGRNO00468 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGRNO00468 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGRNO00468 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGRNO00468 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGRNO00468 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGRNO00468 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGRNO00468 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGRNO00468 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGRNO00468 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGRNO00468 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGRNO00468 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGRNO00468 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGRNO00468 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGRNO00468 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGRNO00468 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGRNO00468 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AGRNO00468 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGRNO00468 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGRNO00468 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGRNO00468 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGRNO00468 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGRNO00468 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGRNO00468 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGRNO00468 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGRNO00468 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGRNO00468 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGRNO00468 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGRNO00468 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGRNO00468 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGRNO00468 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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AGRNO00468 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGRNO00468 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGRNO00468 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGRNO00468 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGRNO00468 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGRNO00468 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGRNO00468 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGRNO00468 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGRNO00468 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGRNO00468 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGRNO00468 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGRNO00468 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGRNO00468 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AGRNO00468 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AGRNO00468 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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