Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD8B2A6NJW9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms