Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WWV3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
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