Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 ZKSCAN3-201ENST00000252211 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ITPK1-AS1-201ENST00000553639 4701 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FAR1-201ENST00000354817 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMIZ2-215ENST00000615423 2772 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM33-203ENST00000504986 7482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKS1B-211ENST00000547776 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNAB2-204ENST00000378083 4142 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NUMB-214ENST00000555238 3588 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RGS3-204ENST00000350696 4387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TNFAIP3-210ENST00000620204 3817 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GSDMC-201ENST00000276708 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 IQGAP3-201ENST00000361170 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SHPRH-211ENST00000629427 7338 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 OR1D2-203ENST00000641833 4887 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NFIA-207ENST00000403491 9487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DAAM2-208ENST00000538976 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AP1G1-218ENST00000569748 4554 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CMTR1-201ENST00000373451 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MYT1-205ENST00000622439 2140 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF75D-202ENST00000370766 5592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NFE2L1-203ENST00000362042 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MYL6B-211ENST00000553066 1305 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PARP9-201ENST00000360356 3198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC24A1-211ENST00000544319 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CRHR1-206ENST00000398285 2399 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 UBOX5-202ENST00000348031 4469 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR2M-201ENST00000299638 4199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SERPINA1-207ENST00000440909 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CAMK2B-209ENST00000395749 4447 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FAIM2-201ENST00000320634 4654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 XIRP2-206ENST00000409728 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PLD2-205ENST00000572940 3391 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PLXNA3-201ENST00000369682 10885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC090197.1-202ENST00000519692 4374 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC39A14-203ENST00000359741 4641 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NOL10-201ENST00000345985 3333 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PROS1-202ENST00000394236 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF581-201ENST00000270451 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR81-201ENST00000309182 3808 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AZIN2-202ENST00000373440 616 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HLA-DQA1-202ENST00000374949 1060 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PGAM1P4-201ENST00000397343 750 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HBA1-202ENST00000397797 504 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL353747.1-201ENST00000404577 267 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV3D-15-201ENST00000417279 396 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP4F62P-201ENST00000417310 524 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL049795.1-202ENST00000421616 786 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00454-201ENST00000425483 503 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000344.1-203ENST00000426024 163 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PHKG1P4-201ENST00000430144 370 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL353653.1-202ENST00000435177 539 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007952.3-203ENST00000439868 392 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.2 ms