Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 CACNA2D2-206ENST00000479441 3453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 MRPL22-206ENST00000522038 3162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 CTBP2-203ENST00000337195 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 MAP2K6-206ENST00000590474 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 CLN8-201ENST00000331222 7169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 LDAH-209ENST00000440866 3728 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 DHX30-207ENST00000457607 3748 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC02487-201ENST00000400831 2557 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 CSRNP1-202ENST00000514182 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 CACNA1E-201ENST00000357570 7064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 CACNA1E-206ENST00000367573 7067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 TXNDC2-202ENST00000357775 2830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 MAPK1IP1L-205ENST00000622254 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 VDR-202ENST00000395324 4762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 NEK6-205ENST00000394199 2535 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 RABGEF1-203ENST00000439720 3065 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF559-213ENST00000603380 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 ACO1-202ENST00000379923 3601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 ZKSCAN3-201ENST00000252211 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 TRPM8-204ENST00000433712 5291 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 TMEM33-203ENST00000504986 7482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 SV2A-202ENST00000369146 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 KCNAB2-204ENST00000378083 4142 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 AGPAT1-206ENST00000395499 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 M1AP-202ENST00000409585 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 RGS3-204ENST00000350696 4387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 AMER3-201ENST00000321420 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 ENPP2-203ENST00000427067 3271 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 EREG-201ENST00000244869 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 IQGAP3-201ENST00000361170 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 SHPRH-211ENST00000629427 7338 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 NFIA-207ENST00000403491 9487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 DAAM2-208ENST00000538976 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 DLD-201ENST00000205402 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 AP1G1-218ENST00000569748 4554 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 YY1AP1-202ENST00000311573 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 SRRM5-202ENST00000607544 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 TTK-208ENST00000509894 3725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 TMEM198B-202ENST00000478241 2924 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 ADAM1A-201ENST00000424240 2129 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF75D-202ENST00000370766 5592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 NFE2L1-203ENST00000362042 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC00969-212ENST00000445430 4208 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 ADCY4-204ENST00000554068 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 UBOX5-202ENST00000348031 4469 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 FCAMR-201ENST00000324852 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 SIRPB2-201ENST00000359801 2642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 AC009090.4-201ENST00000623921 3691 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 SIDT2-220ENST00000628876 2609 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 ADAM22-201ENST00000265727 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 THUMPD3-206ENST00000452837 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 ZIK1-207ENST00000599456 2860 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 POLR2M-201ENST00000299638 4199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 CAMK2B-209ENST00000395749 4447 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 FAIM2-201ENST00000320634 4654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 MIR100HG-212ENST00000531381 3370 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 AC135050.1-201ENST00000622229 3380 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 AC104667.1-201ENST00000417947 2057 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 NBPF19-204ENST00000611931 2051 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 NBPF26-205ENST00000615219 2051 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 PLXNA3-201ENST00000369682 10885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 ADGRE2-209ENST00000596991 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC39A14-203ENST00000359741 4641 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.2 ms