Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNNQ9UQP3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNQ9UQP3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms