Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HPS5Q9UPZ3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms