Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZRN3Q9UPQ7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZRN3Q9UPQ7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms