Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ZNF608Q9ULD9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZNF608Q9ULD9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms