Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VNN3Q9NY84 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
VNN3Q9NY84 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
VNN3Q9NY84 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
VNN3Q9NY84 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
VNN3Q9NY84 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VNN3Q9NY84 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VNN3Q9NY84 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VNN3Q9NY84 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VNN3Q9NY84 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VNN3Q9NY84 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VNN3Q9NY84 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VNN3Q9NY84 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VNN3Q9NY84 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VNN3Q9NY84 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VNN3Q9NY84 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VNN3Q9NY84 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VNN3Q9NY84 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VNN3Q9NY84 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VNN3Q9NY84 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VNN3Q9NY84 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VNN3Q9NY84 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VNN3Q9NY84 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VNN3Q9NY84 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VNN3Q9NY84 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VNN3Q9NY84 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms