Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRMT1Q9NXH9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms