Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ASF1BQ9NVP2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms