Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms