Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms