Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZY4

COA1, Cytochrome c oxidase assembly factor 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA1Q9GZY4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COA1Q9GZY4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COA1Q9GZY4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COA1Q9GZY4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COA1Q9GZY4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COA1Q9GZY4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COA1Q9GZY4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COA1Q9GZY4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COA1Q9GZY4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COA1Q9GZY4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COA1Q9GZY4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms