Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
AMBRA1Q9C0C7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AMBRA1Q9C0C7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms