Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms