Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRDL1Q9BU40 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms