Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NIPSNAP3BQ9BS92 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms