Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHOXF2Q9BQY4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms