Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ECSITQ9BQ95 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ECSITQ9BQ95 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ECSITQ9BQ95 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms